logo Środowiskowa Pracownia Spektrometrii Mas
  • Aktualności
  • O nas
  • Sprzęt
  • Publikacje
  • Opłaty
  • Zlecenia
  • Kontakt

Select your language

  • polski
  • English
  • Aktualności
  • O laboratorium
  • Działalność usługowa
    • Pomiar masy
    • Identyfikacja białek
    • Modyfikacje potranslacyjne
    • Proteomika globalna
    • Proteomika celowana
    • Analiza ilościowa związków niskocząsteczkowych
    • Pracownia Oznaczania Leków i Metabolitów
    • Opłaty za usługę
  • Działalność naukowa
    • Projekty
      • Projekt TEAM TECH
    • Publikacje
    • Proteomika strukturalna
      • Projekt Maestro
    • Oprogramowanie
    • Współpracownicy
    • Patenty
  • Sprzęt
  • Media
  • Kontakt

Dla klienta

  • Załóż konto
  • Nowe zamówienie
  • Odbierz wyniki
  • Formularze zamówień
  • FAQ - proteomika

Jak wyglądają wyniki pomiaru masy?

Wyniki wysyłamy na podany adres mailowy w formacie obrazu .tif. Otrzymają państwo dwa rysunki, jeden w domenie m/z (masa do ładunku), drugi (jeśli to konieczne) po dekonwolucji na mase M (lub M+H).

Czas oczekiwania na wynik to 1-2 dni robocze od daty otrzymania próbki.

Jaka musi być minimalna ilość białka / peptydu w próbce?

Minimalne ilości potrzebne do pomiaru masy to 1-10 µg (w 100µl, jeśli jest to roztwór).

Jaka może być maksymalna masa białka?

Wykonujemy pomiary białek o masie równej max. 60 kDa.

Minimalna ilość białka

Do trawienia z precypitatu lub roztworu potrzebujemy minimum 10ng białka (jeśli jest to roztwór to podana ilość w 20µl).

Co przeszkadza w pomiarze MS?

Dostarczane do nas próbki nie powinny zawierać SDSu (dopuszczalne <0.5%), mocznika (dopuszczalne <1M), inhibitorów proteaz oraz detergentów (Triton, Tween, Nonidet, Igepal itp.). Próbka powinna być stabilna w roztworze o pH w przybliżeniu równym 8 - 8.5.

W jaki sposób przygotować próbkę do wysyłki?

Próbkę proszę wysyłać w ependorfie, w odpowiednich warunkach w których próbka jest stabilna.

W jaki sposób wysłać próbkę?

Kilka praktycznych uwag jak przysłać do nas próbki na identyfikację:

  • Próbki żelowe bez względu na ich rozmiar prosimy umieszczać w ependorfach o pojemności 1.5ml;
  • Prosimy nie dzielić żelu na zbyt małe kawałki, optymalne to około 1x1 mm;
  • Próbek z żelu nie trzeba zalewać żadnym roztworem;
  • Próbki z żelu lub w postaci osadu (precypitatu) mogą być przesyłane bez lodu, próbki w formie roztworu powinny być zamrożone;
  • Nazwy próbek nie powinny zawierać więcej jak 8 znaków;
  • Probówek prosimy nie oklejać z zewnątrz taśmą ani innymi naklejkami, wystarczy podpis markerem na wieczku i z boku;
  • Prosimy o wypełnianie tylko jednego formularza zlecenia dla przysyłanych próbek;
  • Po złożeniu zlecenia w elektronicznym systemie ewidencji próbek prosimy o wydrukowanie wygenerowanego pliku PDF zawierającego dane wpisane w formularzu, podpisanie go i przesłanie razem z próbkami do nas.

Protokoły

Trawienie trypsyną w żelu SDS PAGE

Trawienie trypsyną białek w roztworze

Barwienie żeli srebrem wg. Shevchenko