Laboratorium rutynowo przeprowadza jakościową analizę próbek białkowych o różnym stopniu złożoności – od czystych białek po złożone mieszaniny.
Standardowa procedura jakościowej analizy próbki białkowej metodą spektrometrii mas obejmuje następujące etapy:
- redukcję i alkilację mostków dwusiarczkowych białek, a następnie trawienie trypsyną w celu uzyskania mieszaniny peptydów;
- rozdzielenie próbki za pomocą chromatografii cieczowej (LC), pomiar peptydów metodą MS oraz ich widm fragmentacyjnych (spektrometria mas tandemowa);
- przeszukiwanie uzyskanych widm względem wybranej bazy sekwencji białkowych (NCBI, UniProt lub dostarczonej przez klienta) przy użyciu silnika wyszukiwania Mascot (matrixscience.com), Proteome Discoverer, MaxQuant, DIA-NN lub Spectronaut.
Typy próbek, które rutynowo analizujemy jakościowo:
- pasy żelowe – barwione błękitem Coomassie lub srebrem,
- pellety,
- roztwory białek,
- kulki z immunoprecypitacji (IP beads)
Najczęściej protokół przygotowania próbki wymaga wcześniejszej konsultacji z naszym personelem, aby zapewnić zgodność. Prosimy o kontakt bez wahania.
Informacje o statusie analizy oraz szczegóły dotyczące dostępu do danych zostaną przesłane na adres e-mail podany w formularzu zgłoszeniowym.
Standardowa analiza jakościowa jest realizowana jako usługa i może być zamówiona online za pośrednictwem naszego systemu obsługi zleceń.